龙井二人朝着枯叶市的方向，路过一座灯塔，二人见天色逐渐暗下，决定到这里住一晚，二人走向了灯塔。

　　石门上全是神奇宝贝，刻印的栩栩如生，龙井按下了一旁的门铃，却没有人说话，石门被打开了。

　　里面漆黑一片，突然，不知什么东西出现在了二人面前，这时，灯亮了起来，二人看清楚了眼前的这东西，原来是化石盔，但个头却是一半个头的好几倍。化石盔说出了一句话：“你们是神奇宝贝训练师吗？”龙井二人答道：“没错！”

　　化石盔转过身来，接着说：“那么帮我把按钮按一下。”龙井上前寻找着按钮，化石盔接着说：“因为化石盔的手太短了，按不到那里。”

　　龙井按下了按钮，一阵白光闪过，一个黑发少年出现在了二人面前。

　　他说道：“你们两个好啊，我是神奇宝贝研究员正辉。”

　　妙天上前问道：“这是布偶吗？”正辉答道：“这是很精细的皮套，化石盔是绝种的神奇宝贝。但是，即便是绝种了的神奇宝贝，也是有‘心’的。”

　　“心？”二人疑惑。正辉说道：“因为我想知道神奇宝贝们究竟是以什么样的心情活在这个世界上的，所以进入着皮套中，进行研究。对了，今天晚上，这里回来一只独一无二的精灵，你们两个要不要来看看呢。”龙井二人相对视后，都点了点头。

　　就在三人刚走向台阶时，一阵歌声传来，三人便跑了过去。

　　一只巨大的神奇宝贝出现在了海平面，慢慢向着灯塔走来。这时，海面上大雾弥漫，巨大的神奇宝贝在雾中慢慢显出了他的身影。

　　龙井与妙天接着他的身形好不容易才认出是快龙，说道：“没想到居然是快龙。”妙天接着说道：“但这个头也太大了吧。”

　　快龙出现在了灯塔旁，歌声更加动听。

　　这时，一颗巨大的炮弹从天而降，正中快龙的腰间，快龙被炮弹冲击倒向龙井这方，塔顶被快龙给压坏了，快龙逐渐向下，这时，炮弹又来了一发，快龙被这发炮弹击中，渐渐昏迷过去，三人拼了命好不容易才从这里出来，刚出来时，一架小型飞艇慢慢降了下来....一个人出现在了三人的视线里.....

　　龙井说道：“你是谁？为什么要伤害快龙？”那人听了这声音，转过了头来，看着下方的龙井：“没想到会在这里遇见你啊，宫崎龙井。不过，据你现在的实力是伤不了我的....”说完，一个球抛向了快龙，快龙被收了进去。

　　“什么，居然把快龙给收复了。那个精灵球究竟时怎么回事。”精灵球回到了那人身边，这时，大雾散去，一个巨大的飞艇出现在了三人面前，“什么，这巨大的飞艇是什么时候来的！？”“那么，再会了，宫崎龙井。”小型飞艇被启动了，慢慢飞向飞船上。

　　飞船启动后，募得消失在了三人面前。

　　龙井说道：“那究竟是什么人？居然用那种方法收复精灵。”

　　妙天站在一旁，心里想到：大人居然会让他来执行这项行动，这是打什么主意呢。莫非，是那个计划被提前启动了？

　　正辉因为想马上去调查飞船去向，所以先走了，龙井两人也是在某个森林中过夜。

　　第二天，二人往枯叶市的方向继续前进....

　　枯叶市神奇宝贝中心，少女的心跳动着，想到：龙井，我知道你就要接近我了。