公元885年正月，代理京兆尹王徽向朝廷汇报，长安宫室基本修复，百司衙门也有了头绪。僖宗皇帝下了回銮长安的决心，正月二十二日，皇帝的车驾从成都出发，文武百官跟随僖宗踏上了回都城长安的路。陈敬瑄一直送到汉川，才拜别僖宗回成都。

　　　　也就是在这个月，秦宗权发兵攻打颍州和亳州，朱温亲自领兵去救援颍、亳。大将葛从周为先锋，在许州长葛县境遇到秦宗权手下敌将殷铁林和九寨都虞侯王涓。葛从周与蔡州兵马在灵井大战，把蔡州兵马杀得大败。汴州军一路追杀至扶沟（在许州东部），与敌战于焦夷（今安徽亳县境内）。这一仗汴军杀敌三千余人，活捉了敌将殷铁林和王涓，大获全胜。葛从周命人砍下了两位敌将的头颅，巡示全营，朱温也派人向朝廷报捷。

　　　　公元885年三月，僖宗李儇回到了长安。进入长安以后李儇只见此时的长安遍地荆棘丛生，原来繁华的大街上都有狐兔横行，不禁很悲伤。关于当年长安几经战乱破烂不堪的景象诗人韦庄在他的《秦妇吟》中有非常具体的描写。

　　　　他写道：

　　　　长安寂寂今何有，废市荒街麦苗秀。

　　　　采樵斫尽杏园花，修寨诛残御沟柳。

　　　　华轩绣縠皆消散，甲第朱门无一半。

　　　　含元殿上狐兔走，花萼楼前荆棘满。

　　　　昔时繁盛皆埋没，举目凄凉无故物。

　　　　内库烧成锦绣灰，天街踏尽公卿骨。

　　　　既然回到长安，这总算一件喜事吧，僖宗李儇宣布大赦天下，并改元称天启年号。这时李儇小朝廷可控制的范围只有河西、剑南、岭南数十州县而已。

　　　　正在僖宗皇帝刚到长安的时候不久又接到报告说秦宗权在蔡州称帝的消息。秦宗权这个反贼竟冒天下之大不韪，置百官称帝，仍沿用黄巢的大齐国号。僖宗李儇不禁大怒，封武宁节度使时溥为蔡州四面行营兵马都统，命令他负责讨伐秦宗权。时溥这时自保都困难，哪有能力去攻秦宗权。秦宗权的军队在中原东杀西侵，纵横二十几个州。他还派出手下大将孙儒去攻东都洛阳，防守东都的唐将李罕之与孙儒相拒几个月，终因兵少食尽，退出洛阳，西保渑池。只不过孙儒在东都也只呆了一个月，把洛阳抢掠一空，实在没什么可抢的了，自动撤出东都，李罕之这才又回到东都。

　　　　在中原现在秦宗权只有两块啃不动的骨头，那就是朱温的汴州和赵犨的陈州。陈州距蔡州仅百余里，兵力也不多，可秦宗权就是攻不下陈州。朱温与赵犨惺惺相惜军事上结成联盟，私人间又结成儿女亲家，共同对抗秦宗权。朱温的女儿（朱温纂唐后称长乐公主）许配给了赵犨的儿子赵岩，两家更加亲近。朱温还上奏朝廷保举赵犨为蔡州节度使，八月份僖宗下诏任命赵犨为蔡州节度使，只不过他得等赶走秦宗权才能上任。

　　　　僖宗回到长安，大太监田令孜也随行回到长安。田令孜不仅自己回到长安，他还带来了在成都新招募的五十四都兵马。这五十四都，每都壹千人，共分为十队，隶属于两神策军，也就是由田令孜掌管。这些军队再加上南衙北司的上万名官员，给长安李儇小朝廷带来不小的负担。藩镇财税自专，大多不上缴朝廷，财政出现困难，士兵发不了饷多有怨言。先是，安邑、谢县有两大盐池，由朝廷派出的盐铁官管理，岁入朝中。可几经战乱，现在已经被大军阀王重荣占据，他每年只向朝廷交三千车盐就算完事。田令孜奏请僖宗恢复旧制，收复两盐，用盐税来养军队。四月田令孜自任两池榷盐使，并派出养子匡祐去河中接管盐池。王重荣自然不服，把匡祐赶回了长安。田令孜是僖宗的阿父，在朝中说一不二，五月份即下下命令调王重荣为泰宁节度使，让他离开两大盐池，以泰宁节度使齐克让为义武节度使，以义武节度使王处存为河中节度使，并命令李克用援助王处存到河中赴任。

　　　　王重荣岂肯听田令孜调遣，坚决不肯到兖州赴任，多次上表朝廷说田令孜离间君臣，告田令孜贪腐等十项罪名。田令孜秘结邠宁节度使朱玫和凤翔节度使李昌符对抗王重荣，双方矛盾渐渐激化。