平安时代，佐为曾担任天皇的围棋导师，遭奸人作弊所陷害，含冤投水自尽，遗恨极深，灵魂无法成佛，并寄宿在棋盘之中。到了江户时代，降临至今仍有最强棋士之称的本因坊秀策身上，140年之后，再次遇到能看见自己的进藤光，对能在现实世界再次下棋，感到无比欣慰，希望中有一天能达到神乎其技的境界。阿光进步神速，佐为下了绝妙的一局，但进藤光竟然看出更高的一着，让佐为领悟到，神要他等了一千年，就是要让进藤光看到这一局棋，带领进藤光走进追求神乎其技的道路